国指定重要文化財本堂内薬師如来厨子

菊の御紋が輝く金色の宮殿厨子。今川義元公より寄進され、中には秘仏である本尊の薬師如来が安置されています。室町時代の名作といわれ、梁の上を飾る山形の優美な蛙股（かえるまた）が特徴的です。天正年間(1572〜1592)に扉の金具などの修理を行った記録が残っており、それより以前に建立されたことがわかっています。昭和42年(1967)に文化庁の指導の下、全解体と復元を行い建立当初の美しい姿を取り戻しました。山頂の薬師本堂内で見ることができます。

国指定重要文化財三重塔

建久元年（1190）に源頼朝公から眼病平癒のお礼として建立されました。その後、頼朝の寵臣であった工藤祐経（すけつね）が薬師堂と同じく、普請奉行に当たったと伝えられています。一説によると、戦国時代の兵火にさらされ、安土桃山時代から江戸時代前期にかけて再建したといわれています。豪壮な木割や強大な相輪、屋根の美しい反り、屋根を支える複雑な枡組（ますぐみ）など、桃山時代の特徴をよく表しており、滋賀県の長命寺と京都府の宝積寺（ほうしゃじ）の三重塔と共に「安土桃山期の三名塔」の一つに数えられています。塔の高さはおよそ23メートル、上層は禅宗様式と大仏様式を用い、中下層は和様式で作られています。上層にいくほど塔身が細くなるよう設計されており、安定感のある美しい塔です。中には弘法大師の作である金剛界大日如来を安置しています。全解体修理を昭和42年(1967)に行い、昭和44年(1969)に復元が完了しました。

国指定重要文化財山　門

山内の入り口に構える山門は、元は掛川城の大手門でした。万治2年（1659）に井伊直好（なおよし）公によって建てられ、明治6年(1873)廃城令の際に城主であった太田備中守が眼病平癒のお礼として、当山に寄進し移築されました。一層の屋根が表裏にある二層片潜付城門は、全国的にも珍しい造りであるといわれています。屋根の最上部を飾る鯱鉾（しゃちほこ）は江戸時代初期の名作といわれ、国の重要文化財に指定されています。鯱鉾は現在、方丈にて見ることができます。昭和46年(1971)、山門の復元修理を行いました。